53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3496 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  72.83 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  71.13 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  70.33 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  67.31 
 
 		 115 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  70.97 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  62.77 
 
 		 107 aa  129  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  58.14 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  55.29 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  54.84 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  37.97 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  31.71 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  36.14 
 
 		 195 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  35.06 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  33.33 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  35.8 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  30.12 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  31.58 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  34.94 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  32.61 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 298 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 98 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 289 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  24.18 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  32.1 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  31.33 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  35.11 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 283 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>