92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1290 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 103 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  66.33 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  45.83 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  45.12 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  36.36 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  36.9 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  35.63 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  34.44 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  32.22 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  34.94 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  34.74 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  34.78 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  40.18 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  32.22 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  36.05 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  36.47 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  37.07 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 289 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  34.07 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  22.34 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  32.65 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  32.53 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  29.87 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 305 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  27.85 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 124 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  27.85 
 
 		 124 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 116 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 124 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 133 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  23.08 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  25.32 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  28.57 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>