114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2305 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  71.74 
 
 		 108 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  71.74 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  70.65 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  70.79 
 
 		 115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  70.79 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  62.77 
 
 		 123 aa  129  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  57.65 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  53.01 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  46.74 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  38.2 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  41.98 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  41.46 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  40.23 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  35.23 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  37.18 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  37.21 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  31.25 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 180 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  32.94 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  29.76 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  38.03 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  33.67 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  31.94 
 
 		 243 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 298 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  32.5 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 289 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  29.41 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 302 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 252 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 242 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 242 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  28.09 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  30.12 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 227 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  30.99 
 
 		 243 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  30.99 
 
 		 243 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>