More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2183 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2183  transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000038716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2182  MerR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.565619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  22.3 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  26.87 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3961  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 132 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.79 
 
 		 136 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  40.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1613  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000103656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  29.73 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.48 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  35.56 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  28.77 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.91 
 
 		 147 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  34.67 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.48 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.39 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 149 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 137 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  38.24 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  28.33 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  25.15 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  26.36 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  25.15 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 134 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>