72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3961 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3961  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2182  MerR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.565619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2183  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000038716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  18.89 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 308 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  28.77 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 134 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  32.11 
 
 		 136 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2090  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 143 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  26.96 
 
 		 144 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 188 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  34.23 
 
 		 133 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  35.63 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  34.38 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  28.12 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  35.48 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.43 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  29.2 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  27.55 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  27.55 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 342 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 342 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 342 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 159 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 175 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  35.48 
 
 		 315 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 343 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  33 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 146 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  29.47 
 
 		 129 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0082  MerR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 117 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0086  MerR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 117 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 343 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 149 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  30.21 
 
 		 122 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 253 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>