More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3050 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  100 
 
 
273 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2183  transcriptional regulator  26.87 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000038716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2182  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.565619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  22.14 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1613  MerR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000103656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.04 
 
 
138 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.04 
 
 
138 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.04 
 
 
138 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.04 
 
 
138 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.04 
 
 
138 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
141 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.56 
 
 
135 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.56 
 
 
135 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  38.57 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  30.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  30.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.01 
 
 
136 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  21.68 
 
 
342 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  21.68 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  21.68 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
135 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  36 
 
 
159 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 
171 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  30.7 
 
 
148 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 
173 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  28.7 
 
 
153 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  28.7 
 
 
134 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 
148 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 
148 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  30.56 
 
 
171 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  30.56 
 
 
171 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  30.61 
 
 
135 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  30.56 
 
 
176 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 
144 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
136 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  30.56 
 
 
176 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
175 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 
137 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 
177 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  20.8 
 
 
343 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  31.07 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
134 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
159 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  30.28 
 
 
157 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  39.68 
 
 
64 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
157 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 
154 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  27.62 
 
 
147 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  35.94 
 
 
342 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
153 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  20.35 
 
 
343 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
161 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
277 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
134 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
136 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
137 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
256 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
136 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  34.62 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 
157 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 
143 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
134 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
134 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
134 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  25.69 
 
 
133 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
139 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  35.8 
 
 
157 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
343 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
134 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 
159 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
142 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>