More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3623 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  27.17 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  27.17 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  28.93 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  26.81 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  26.12 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  22.39 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.01 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  28.76 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  23.25 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 185 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  24.72 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  28.21 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.01 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  21.98 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  29.69 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  25.78 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  28.28 
 
 		 334 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  26.28 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  33.03 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  26.02 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  29.81 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  28.18 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  21.61 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  27.33 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  27.18 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  22.73 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  25.56 
 
 		 144 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  40.58 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  29.47 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  28.28 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  27.03 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  26.42 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  22.71 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  28.16 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 132 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  24.46 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 131 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  25.17 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  25.69 
 
 		 132 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  20.29 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  21.93 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  22.09 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  32.53 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 154 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  25.56 
 
 		 144 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 130 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  25.64 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>