More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3825 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 280 aa  579  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  31.21 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  31.8 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  31.8 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.11 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  23.94 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  27.82 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  27.44 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.87 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  27.21 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  23.43 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  25.45 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.52 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  25.36 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  25.78 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  25.09 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  27.02 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  24.91 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  26.3 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  24.2 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  23.05 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  24.45 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  25.09 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  24.25 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.26 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  29.09 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  23.83 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  23.36 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  22.03 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  22.02 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  19.79 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.53 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  27.52 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.37 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  24.09 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.43 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  21.88 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  30 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 161 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>