104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1206 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  50 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  36.52 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  38.6 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  36.84 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  39.08 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  31.45 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  29.84 
 
 		 158 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  33.33 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 279 aa  62  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  29.51 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  27.56 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  40.62 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.77 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  40 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  30 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  31.71 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  39.73 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  34.09 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.28 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  30.47 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 292 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.17 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  27.34 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  29.7 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 262 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  35.37 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 293 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 293 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 276 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  26.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  30 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  27.84 
 
 		 276 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  27.27 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.34 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.47 
 
 		 294 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  32.81 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  32.79 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  26.09 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.55 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 276 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  39.66 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  30.86 
 
 		 271 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 314 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  25.2 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  43.9  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  30 
 
 		 550 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  27.01 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 280 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  27.59 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  29.2 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 264 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  29.6 
 
 		 273 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  30.77 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  28.18 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  40 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  32.39 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  31.03 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 		 269 aa  42  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  29.01 
 
 		 273 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  29.21 
 
 		 209 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  27.43 
 
 		 257 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  27.43 
 
 		 298 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 276 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  28.24 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 264 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  32.58 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 276 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  25.78 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  25.44 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  31.4 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  26.44 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>