59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0304 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 158 aa  321  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  50.64 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  49.68 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  37.41 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.25 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  29.77 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  26.85 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  27.91 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  27.63 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.14 
 
 		 550 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  29.84 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.68 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  24.83 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  31.97 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  31.62 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.81 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  26.09 
 
 		 267 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  23.49 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.05 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.28 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  21.64 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  31.73 
 
 		 286 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 		 286 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  25.38 
 
 		 241 aa  50.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  27.46 
 
 		 258 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  25.89 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  25.19 
 
 		 242 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  26.25 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.29 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  26.42 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 265 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 281 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  25.9 
 
 		 242 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 		 314 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  22.46 
 
 		 268 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  23.19 
 
 		 243 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 279 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  28.7 
 
 		 236 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  25.83 
 
 		 252 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  25.52 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  31.4 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  21.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  34.55 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  23.88 
 
 		 240 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4616  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.45 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  26.09 
 
 		 259 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.5 
 
 		 210 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0410  transcription activator effector binding  23.45 
 
 		 227 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122194  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  25.69 
 
 		 257 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  36.11 
 
 		 207 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  25.69 
 
 		 298 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 269 aa  40.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  27.18 
 
 		 249 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>