43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3571 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  77.34 
 
 		 203 aa  333  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  62.56 
 
 		 207 aa  277  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  62.07 
 
 		 203 aa  274  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  47.06 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  46.57 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  46.31 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  45.05 
 
 		 213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  49.26 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  45.81 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  46.31 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  45.63 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  46.27 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  48.04 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  46.19 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  40.58 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  42.51 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  42.31 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  39.9 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  39.05 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  39.13 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  36.63 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  37.91 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  35.44 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  37.62 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  34.8 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  32.97 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  31.49 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  29.44 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  28.89 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  37.7 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  42.11 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  41.38 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  34.29 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  34.78 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  32.79 
 
 		 132 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  34.55 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 301 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>