34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0605 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  45.89 
 
 
210 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  36.8 
 
 
234 aa  154  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  36.67 
 
 
208 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  38.79 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  37.56 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  35.85 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  35.85 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  34.98 
 
 
207 aa  128  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  35.98 
 
 
210 aa  125  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  35.68 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  34.43 
 
 
210 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  37.62 
 
 
203 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  35.07 
 
 
207 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  31.8 
 
 
216 aa  121  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  34.95 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  36.95 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  32.51 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  32.21 
 
 
204 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  29.5 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  29.84 
 
 
207 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  28.93 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  30.92 
 
 
211 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  29.56 
 
 
211 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  28.08 
 
 
205 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  31.4 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  28.29 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  31.35 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  21.81 
 
 
170 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  31.35 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  21.81 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  40.28 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>