38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1629 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  68.18 
 
 
213 aa  278  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  60.2 
 
 
218 aa  255  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  56.22 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  58.13 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  61.95 
 
 
210 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  52.45 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  50.73 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  54.19 
 
 
211 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  46.31 
 
 
203 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  51.49 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  44.33 
 
 
203 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  42.36 
 
 
203 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  40.2 
 
 
204 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  44.81 
 
 
214 aa  141  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  35.75 
 
 
207 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  38.5 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  39.23 
 
 
199 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  37.63 
 
 
210 aa  122  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  39.05 
 
 
210 aa  121  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  32.09 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  33.01 
 
 
208 aa  118  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  34.31 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  28.08 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  34.88 
 
 
216 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  29.32 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  32.38 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  36.9 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  37.82 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1539  Protein of unknown function DUF2174-like protein  29.28 
 
 
242 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  23.94 
 
 
172 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  25.26 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 
267 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  23.4 
 
 
172 aa  42  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  34.67 
 
 
274 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  40.32 
 
 
155 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0816033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>