38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4914 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  47.83 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  37.98 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  37.5 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  35.81 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  39.05 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  40.09 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  39.52 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  36.54 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  39.25 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  33.95 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  37.44 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  36.67 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  34.88 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  35.75 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  35.75 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  35.41 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  35.07 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  30.34 
 
 		 234 aa  121  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  38.76 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  35.71 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  35.98 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  33.97 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  32.72 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  34.22 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  36 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  34.29 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  30.41 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  30.24 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  26.09 
 
 		 132 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  26.56 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  37.5 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  38.18 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  26.04 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  26.04 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  27.54 
 
 		 155 aa  41.6  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>