31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1500 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  354  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  97.67 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  90.12 
 
 		 172 aa  325  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  28.34 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  30.39 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  31.52 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  26.46 
 
 		 214 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  29.38 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  28.18 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  28.14 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  31.35 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  28.89 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  24.06 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  28.11 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  26.02 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  27.08 
 
 		 210 aa  50.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  26.9 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  27.18 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  26.4 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  27.04 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  28.96 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 279 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  25.98 
 
 		 216 aa  45.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.58 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  24.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  25.4 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  36.76 
 
 		 209 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>