35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1787 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  100 
 
 
218 aa  447  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  75.12 
 
 
211 aa  329  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  62.93 
 
 
207 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  69.31 
 
 
210 aa  261  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  60.2 
 
 
205 aa  245  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  59.09 
 
 
213 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  48.53 
 
 
203 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  51.98 
 
 
206 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  47.06 
 
 
203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  49.74 
 
 
209 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  53.23 
 
 
211 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  50.47 
 
 
210 aa  188  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  46.08 
 
 
207 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  44.61 
 
 
203 aa  185  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  43.69 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  41.87 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  40 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  38.31 
 
 
199 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  41.51 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  36.15 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  34.91 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  40.38 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  34.78 
 
 
208 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  34.76 
 
 
234 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  34.15 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  32.51 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  31.25 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  32.88 
 
 
216 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  37.5 
 
 
170 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  29.69 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  28.73 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  28.18 
 
 
172 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  26.63 
 
 
172 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1539  Protein of unknown function DUF2174-like protein  29.44 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>