36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0732 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  446  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  53.95 
 
 
210 aa  242  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  54.67 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  52.56 
 
 
210 aa  237  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  53.88 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  52.83 
 
 
208 aa  232  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  51.64 
 
 
208 aa  216  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  47.17 
 
 
210 aa  207  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  40.48 
 
 
204 aa  148  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  36.67 
 
 
199 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  37.91 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  32.39 
 
 
210 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  33.95 
 
 
207 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  35.35 
 
 
214 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  36.49 
 
 
207 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  31.8 
 
 
207 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  38.03 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  36.79 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  36.92 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  36.02 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  36.45 
 
 
206 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  30.41 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  34.78 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  36.92 
 
 
209 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  32.88 
 
 
218 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  36.98 
 
 
213 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  34.88 
 
 
205 aa  101  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  30.33 
 
 
211 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  35.19 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  24.88 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  26.5 
 
 
172 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  38.03 
 
 
155 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  25.98 
 
 
172 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  25.98 
 
 
172 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 
267 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>