37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1727 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  48.5 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  45.23 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  44.33 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  47 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  44.61 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  43.5 
 
 		 206 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  43.69 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  44.98 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  44.12 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  41.79 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  43.75 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  42.65 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  39.71 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  39.71 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  39.11 
 
 		 199 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  42.27 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  44.81 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  38.03 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  37.83 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  36.23 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  35.55 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  42.31 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  35.35 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  34.95 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  34.76 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  35.71 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  35.29 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  32.24 
 
 		 170 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  30.11 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  26.98 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  26.46 
 
 		 172 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  31.69 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  41.82 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  31.03 
 
 		 132 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  36.36 
 
 		 157 aa  41.6  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>