35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0693 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  62.93 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  55.17 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  58.13 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  53.96 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  55.28 
 
 		 213 aa  201  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  52.48 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  47.06 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  46.12 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  45.63 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  43 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  43.9 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  40.98 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  43.75 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  41.54 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  44.21 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  38.68 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  38.92 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  37.14 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  36.54 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  40.38 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  33.97 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  36.97 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  37.39 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  33.95 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  31.6 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  34.88 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  29.84 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  36.22 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  28.14 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  28.14 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  29.49 
 
 		 267 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>