37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4107 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  65.52 
 
 		 203 aa  285  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  61.58 
 
 		 203 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  62.56 
 
 		 203 aa  277  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  46.08 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  45.15 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  45.27 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  46.8 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  44.33 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  42.08 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  49.02 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  43.9 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  43.84 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  43.35 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  42.86 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  44.61 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  39.42 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  147  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  36.14 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  36.67 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  38.28 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  33.01 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  34.98 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  36.48 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  36.27 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  36.49 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  32.57 
 
 		 170 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  28.96 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  30.39 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  29.83 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  27.87 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  29.73 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  32.79 
 
 		 155 aa  42  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>