19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3492 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  37.41 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  36.73 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  39.86 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.78 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  32.43 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  30.5 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  26.28 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  33.33 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.32 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.13 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  28.28 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 301 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  26.05 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3069  hypothetical protein  25.16 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  28.74 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.39 
 
 		 286 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>