32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2459 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 550 aa  1070    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  25.37 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  28.39 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  28.39 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  30.53 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  27.74 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  32.14 
 
 		 158 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  28.47 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.03 
 
 		 154 aa  63.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  30.47 
 
 		 166 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  26.48 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  29.22 
 
 		 396 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  27.43 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  30.14 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  30.83 
 
 		 164 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.49 
 
 		 158 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  25.94 
 
 		 380 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  28.29 
 
 		 156 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  28.43 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  29.14 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  28.1 
 
 		 274 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  32.58 
 
 		 161 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 301 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 277 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  22.89 
 
 		 343 aa  47  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  27.43 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  26.36 
 
 		 176 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  25.7 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  30 
 
 		 132 aa  44.3  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  24.46 
 
 		 430 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>