41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2240 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  100 
 
 		 430 aa  858    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  26.79 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  25.85 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  24.51 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  26.75 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  22.95 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  26.89 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  23.89 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  28.05 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  26.12 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  26.82 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  31.2 
 
 		 394 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  35.19 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  27.06 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  32.41 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  34.96 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  26.59 
 
 		 395 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  34.26 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  32.54 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  27.44 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  31.95 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  31.95 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  29.09 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  26.26 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  26.26 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  31.13 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  26.26 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  24.18 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  24.38 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  26.26 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  24.03 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  25.98 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  25.98 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.33 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  21.88 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  25.98 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  25.98 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  30.36 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  25.98 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  26.67 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>