31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1753 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  100 
 
 		 394 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  82.07 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  72.59 
 
 		 393 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  65.71 
 
 		 393 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  57.11 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  57.14 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  36.46 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  32.83 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  34.01 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  30.77 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  26.33 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  27.18 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  26.05 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  25.06 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  28.76 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  25.91 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  24.94 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  30.18 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  24.69 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  24.69 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  30 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  24.42 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  32.14 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  26.63 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  31.45 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  28.93 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  23.95 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  25 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  25.17 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  25.09 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  22.13 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>