36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6398 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  773    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  35.04 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  36.47 
 
 
394 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  34.26 
 
 
394 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  37.73 
 
 
398 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  34.26 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  34.36 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  33.85 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  35.4 
 
 
393 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  35.45 
 
 
390 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  27.2 
 
 
376 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  26.65 
 
 
397 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  26.41 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  38.46 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  25.52 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  31.49 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  31.49 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  25.18 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  27.69 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  27.37 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  26.16 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  23.97 
 
 
413 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  33.83 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  33.6 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  26.94 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  29.87 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  34.12 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  22.6 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  24.12 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  25.81 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  34.11 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  25.3 
 
 
380 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  33.93 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  33.33 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30 
 
 
271 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0845  hypothetical protein  22.35 
 
 
358 aa  42.7  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.112448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>