61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1649 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  100 
 
 		 408 aa  818    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  36.05 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  34.14 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  32.72 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  28.69 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  25.83 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  22.65 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  26.21 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  24.81 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  24.81 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  24.94 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  24.94 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  23.98 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  24.81 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  24.69 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  24.63 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  26.49 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  24.69 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  24.63 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  23.13 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  24.73 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  21.32 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  26.45 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  24.51 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  20.65 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  20.65 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  21.6 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  32.98 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  31.48 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  23.72 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  25.37 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  23.53 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  32.14 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  37.33 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  24.49 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  31.37 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  23.4 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  26.35 
 
 		 376 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  33.93 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  27.88 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  36.36 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  28.08 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  31.43 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  22.13 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  34.29 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  34.15 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  34.15 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  34.15 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  34.15 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  34.15 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  34.15 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1419  acyltransferase 3  34.92 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  33.33 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  23.1 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>