34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1907 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  100 
 
 
403 aa  788    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  43.15 
 
 
399 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  40.64 
 
 
413 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  36.76 
 
 
410 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  31.88 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  32.93 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  30.33 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  28.53 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  28 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  27.86 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  23.89 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  26.12 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  25.06 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  25.06 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  29.8 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  26.11 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  26.9 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  26.84 
 
 
430 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  27.61 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  23 
 
 
400 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  25.2 
 
 
405 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  27.82 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  24.31 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  29.75 
 
 
390 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  27.48 
 
 
382 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  26.67 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  22.25 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  22.41 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  25.95 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  28.33 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  26.06 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  24.43 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  24.64 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>