47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1112 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  100 
 
 
403 aa  786    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  36.75 
 
 
408 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  39.36 
 
 
405 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  37.31 
 
 
382 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  25.85 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  29.36 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  23.83 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  22.86 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  26.15 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  32.77 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  24.87 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  26.94 
 
 
385 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  26.42 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  26.42 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  26.42 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  27.82 
 
 
396 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  26.42 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  26.42 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  26.42 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  26.42 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  26.42 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  27.73 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  27.89 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  27.89 
 
 
384 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  37.11 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  24.94 
 
 
385 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  27.89 
 
 
384 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  23.08 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  27.55 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  27.55 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  31.25 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  32.97 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  27.48 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  24.07 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  24.07 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  24.5 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  23.08 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  25.51 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  34.75 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  23.2 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  25.93 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  19.51 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  33.33 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  25.06 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  25 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  26.67 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1419  acyltransferase 3  32.23 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.923798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>