43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2757 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  100 
 
 
413 aa  812    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  82.81 
 
 
399 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  41.38 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  33.33 
 
 
410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  30.36 
 
 
376 aa  183  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  31.46 
 
 
396 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  29.75 
 
 
397 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  28.37 
 
 
387 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  30.88 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  28.25 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  25.94 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  26.75 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  25.43 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  25.43 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  25.55 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  26.02 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  24.81 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  26.91 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  25.91 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  24.63 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  28.19 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  25.51 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  28.66 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  23.95 
 
 
382 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  23.24 
 
 
400 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  30.12 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  27.11 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  23.79 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  27.85 
 
 
400 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  28.24 
 
 
413 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  21.69 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  26.34 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  24.11 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  28.12 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  25.18 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  26.85 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  30.39 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  25 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  24.1 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  26.52 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  38.71 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  21.46 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  27.57 
 
 
394 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>