42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5221 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  50.51 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  34.32 
 
 		 403 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  30.05 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  30.26 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  31.44 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  31.01 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  31.01 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  31.14 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  25.99 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  25.06 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  29.35 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  29.35 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  25.69 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  30 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  23.7 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  29.19 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  25.16 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  27.57 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  25.15 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  23.35 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  31.73 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  28.71 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  22.3 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  24.38 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  25.16 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  24.38 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  24.38 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  25.45 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  25.45 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  25.45 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  24.38 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  24.38 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  25.45 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  21.98 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  25.09 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  24.38 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  24.03 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  24.03 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  24.03 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  24.18 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0275652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>