37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0523 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  100 
 
 
397 aa  793    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  27.03 
 
 
399 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  29.75 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  26.23 
 
 
376 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  27.91 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  26.4 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  26.03 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  26.04 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  27.82 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  27.25 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  26.8 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  28.4 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  24.94 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  22.37 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  27.02 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  25.56 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  24.87 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  24.75 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  24.81 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  23.23 
 
 
419 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  25.42 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  21.28 
 
 
385 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  21.53 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  21.53 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  24.16 
 
 
405 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  25.73 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  31.13 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  31.43 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  23.66 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  30.3 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  32.41 
 
 
430 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  22.68 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  25.9 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  25.81 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  28.04 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  29.31 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  22.06 
 
 
395 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>