34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3712 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3712  acyltransferase 3  100 
 
 		 396 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.193516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1753  acyltransferase 3  82.58 
 
 		 394 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.970862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1787  acyltransferase 3  76.77 
 
 		 393 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1592  acyltransferase 3  67.19 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1099  putative membrane protein of unknown function with acyltransferase family protein domain  59.28 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5400  hypothetical protein  59.03 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  36.88 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  31.33 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  33.5 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5221  hypothetical protein  30.61 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  27.05 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  27.16 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  26.16 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  26.16 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  27.39 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  26.3 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  31.37 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2486  hypothetical protein  30.43 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.200464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  25.8 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  34.3 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  25.75 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  36.11 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1601  hypothetical protein  29.22 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.286212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  31.01 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  26.06 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  24.34 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  25.75 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  30.69 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  25.44 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  22.81 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  35.85 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  24.1 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>