59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2204 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  100 
 
 
389 aa  758    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  30.13 
 
 
421 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  28.64 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  28.69 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  28.1 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  28.22 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  28.22 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  28.22 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  28.93 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  26.96 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  28.22 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  27.97 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  27.52 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  27.97 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  27.97 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1419  acyltransferase 3  29.46 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  28.89 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  27.72 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  28.53 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  28.19 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  25.73 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  25.73 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  25.73 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  25.73 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  26.68 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  25.46 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  33.33 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  26.51 
 
 
396 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  28.73 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2240  acyltransferase 3  28.05 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  28.2 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  24.06 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  38.78 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5571  acyltransferase 3  27.37 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  29.79 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6950  glucans biosynthesis protein  42.11 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.91383  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  31.13 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  28.33 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  22.6 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1907  acyltransferase 3  37.36 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  28.84 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  28.12 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  28.12 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  27.89 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  28.61 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  28.12 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.25 
 
 
550 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  27.75 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  26.97 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6398  hypothetical protein  34.88 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  22.03 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  32.22 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4294  acyltransferase 3  29.09 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  27.71 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  26.56 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  27.07 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2980  hypothetical protein  28.57 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  27.81 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  36.14 
 
 
357 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>