44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4855 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  100 
 
 		 352 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  72.8 
 
 		 350 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  72.24 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  73.73 
 
 		 351 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  69.77 
 
 		 370 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  71.75 
 
 		 351 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  69.12 
 
 		 348 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  50 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  50.29 
 
 		 357 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  45.43 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  48.48 
 
 		 383 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  45.86 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  47.46 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  47.78 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  45.67 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  40.58 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  37.05 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  32.43 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  28.31 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  24.85 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  30.25 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  28.75 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  26.67 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  27.86 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  26.67 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  26.67 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  26.67 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  26.15 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  26 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  27.45 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  26 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  26 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  23.34 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  25.46 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  25.98 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  25.13 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  24.87 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  24.74 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  24.87 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  24.74 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  26.94 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  24.87 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  32.22 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0240982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>