36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1250 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  100 
 
 		 387 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  98.19 
 
 		 387 aa  735    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  90.18 
 
 		 383 aa  624  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  68.84 
 
 		 363 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  61.5 
 
 		 356 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  62.15 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  67.97 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  49.03 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  47.54 
 
 		 352 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  48.48 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  48.45 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  47.67 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  47.75 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  48.77 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  44.81 
 
 		 371 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  36.49 
 
 		 351 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  36.41 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  26.18 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  25.68 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  31.29 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  25.68 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  28.51 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  25.68 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  29.49 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  25.68 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  25.14 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  25.14 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  27.81 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  28.92 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  28.92 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  29.2 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  27.15 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  24.4 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  24.43 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  29.07 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>