38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3182 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  100 
 
 
356 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  71.13 
 
 
372 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  72.84 
 
 
363 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  69.36 
 
 
357 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  64.04 
 
 
387 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  63.71 
 
 
383 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  63.51 
 
 
387 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  50.57 
 
 
350 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  46.09 
 
 
370 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  45.86 
 
 
352 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  46.44 
 
 
348 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  45.4 
 
 
350 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  45.98 
 
 
351 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  47.99 
 
 
351 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  44.19 
 
 
371 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  36.57 
 
 
351 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  37.04 
 
 
350 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  33.13 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  29.62 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  27.08 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  32.08 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  31.45 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  31.45 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  30.82 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  30.82 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  30.43 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  31.65 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  31.65 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  31.45 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  29.75 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  28.66 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  32.5 
 
 
431 aa  62.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  30.16 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  27.14 
 
 
360 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  27.4 
 
 
360 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  29.11 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  20.45 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3690  hypothetical protein  27.81 
 
 
362 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>