65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0387 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  100 
 
 		 369 aa  720    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  28.92 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  26.33 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  27.61 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  30.41 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  29.23 
 
 		 363 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  33.99 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  30.32 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  33.13 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  29.26 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  29.05 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  30.81 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  27.25 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  28.98 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  24.93 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  29.24 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  31.08 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  21.43 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  30.41 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  30.41 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  30.27 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  27.96 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  26.53 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  26.83 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  25 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.020428 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  25.62 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  25.62 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  25.62 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  25.12 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  25.12 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  25.66 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  24.75 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  24.75 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  25.12 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  24.75 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  26.58 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  26.58 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  24.41 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  24.75 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  32.59 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  32.59 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  24.75 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  24.41 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  32.58 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  32.58 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  32.58 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  32.58 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  26.03 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  25.22 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  24.5 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  31.82 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  25.57 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  35.96 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  24.17 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  23.84 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  23.84 
 
 		 331 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  29.8 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  23.84 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  29.05 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  29.05 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  29.05 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  27.89 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2883  acyltransferase 3  32.17 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>