50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0050 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  98.79 
 
 		 330 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  100 
 
 		 330 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  66.47 
 
 		 330 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  68.79 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  63.75 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  59.21 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  58.91 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  58.91 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  59.21 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  58.91 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  58.01 
 
 		 331 aa  384  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  58.01 
 
 		 331 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  58.31 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  58.31 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  58.01 
 
 		 331 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  58.31 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  58.31 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  58.01 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  58.01 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  27.68 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  27.68 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  27.68 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  27.12 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  23.77 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  25.25 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  32.61 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  31.94 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1141  hypothetical protein  25.62 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  hitchhiker  0.0000472475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  24.76 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  28.12 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  27.52 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  24.19 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  26.7 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  29.05 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  22.44 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  43.75 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  23.97 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  26.85 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1862  hypothetical protein  25.15 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.378976  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2961  hypothetical protein  25.15 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3034  hypothetical protein  25.15 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1180  hypothetical protein  26.38 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0744588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  31.72 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  29.25 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1833  acyltransferase 3  37.84 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  27.03 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  26.38 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>