33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2951 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  100 
 
 		 333 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  37.59 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3661  hypothetical protein  27.69 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  28.31 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  28.24 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  28.36 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  26.44 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  27.81 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  33.65 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  26.45 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  27.66 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  30.81 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  26.42 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  24.64 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  28.88 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  37.23 
 
 		 473 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  25.93 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  32.52 
 
 		 435 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  32.52 
 
 		 435 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  36.17 
 
 		 392 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  36.17 
 
 		 392 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  36.17 
 
 		 392 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  36.17 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  22.93 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  35.96 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  27.85 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  35.16 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  26.12 
 
 		 387 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  25.49 
 
 		 387 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  30.85 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>