57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3702 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  100 
 
 
360 aa  722    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  38.67 
 
 
435 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  38.67 
 
 
435 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  38.78 
 
 
392 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  38.78 
 
 
392 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  38.78 
 
 
392 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  38.78 
 
 
392 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  40 
 
 
473 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  28.28 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  27.88 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  24.57 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  29.31 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  25.56 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  25.21 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  26.42 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  25.44 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  30.73 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  25.8 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  30.95 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  33.02 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  25.15 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  29.23 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  29.9 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  25.57 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  25.22 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  32.29 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  29.22 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  24.42 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  35.24 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1850  acyltransferase 3  24.13 
 
 
371 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.889698  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1776  acyltransferase 3  26.13 
 
 
318 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  35.16 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  26.4 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1385  hypothetical protein  25.58 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0431733  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  28.24 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  31.94 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  31.09 
 
 
389 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  31.63 
 
 
368 aa  49.3  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  25.2 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  25.2 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1520  acyltransferase 3  29.17 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  25.2 
 
 
357 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  25.2 
 
 
357 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  24.19 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16030  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  26.97 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109512  hitchhiker  0.000000313895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  21.04 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  31.96 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  34.46 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  24.93 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1534  GumF protein  30.57 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  29.63 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  29.63 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  32.29 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  29.63 
 
 
357 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  30.29 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1338  acyltransferase 3  26.38 
 
 
332 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.179099  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  29.7 
 
 
431 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>