37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1776 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1776  acyltransferase 3  100 
 
 
318 aa  646    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  33.8 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  33.8 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1110  acyltransferase family protein  27.78 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000203806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17520  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  29.91 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0634  hypothetical protein  34.83 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0434683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1544  acyltransferase 3  25.07 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4097  acyltransferase 3  34.45 
 
 
376 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0287  acyltransferase 3  34.48 
 
 
391 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16030  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  44.16 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109512  hitchhiker  0.000000313895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5352  acyltransferase 3  39.29 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  0.0147975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  22.7 
 
 
361 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1350  acyltransferase 3  44.12 
 
 
369 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0722258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  31.16 
 
 
392 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1338  acyltransferase 3  39.51 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.179099  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  31.16 
 
 
392 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  31.16 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  30.56 
 
 
392 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  30.56 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  30.56 
 
 
435 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  30.71 
 
 
473 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3505  acyltransferase 3  34.75 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0364  hypothetical protein  31.36 
 
 
348 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.018012  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0727  acyltransferase 3  34.15 
 
 
610 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0834158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3631  acyltransferase 3  30.23 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.34905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2348  acyltransferase 3  31.54 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4837  acyltransferase 3  31.71 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2204  acyltransferase 3  33.63 
 
 
352 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.517072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  30.88 
 
 
352 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1936  acyltransferase 3  30.37 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  35.23 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3644  acyltransferase 3  35.44 
 
 
344 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000222847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2999  hypothetical protein  40 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  28.25 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1362  Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferase-like protein  32.91 
 
 
675 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01396  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumF  30.77 
 
 
363 aa  43.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0850077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35600  hypothetical protein  40 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110812  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>