46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0634 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0634  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  669    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0434683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  70.15 
 
 
336 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  70.15 
 
 
336 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2348  acyltransferase 3  36.75 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1936  acyltransferase 3  35.74 
 
 
331 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5352  acyltransferase 3  28.74 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  0.0147975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3505  acyltransferase 3  31.23 
 
 
373 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4837  acyltransferase 3  31.23 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1110  acyltransferase family protein  28.49 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000203806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1350  acyltransferase 3  33.82 
 
 
369 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0722258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16030  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  29.14 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109512  hitchhiker  0.000000313895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0287  acyltransferase 3  29.62 
 
 
391 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17520  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  28.72 
 
 
351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1338  acyltransferase 3  27.73 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.179099  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4097  acyltransferase 3  25.87 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1850  acyltransferase 3  26.67 
 
 
371 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.889698  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1362  Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferase-like protein  26.83 
 
 
675 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0364  hypothetical protein  27.06 
 
 
348 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.018012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1428  acyltransferase 3  27.01 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0465028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0727  acyltransferase 3  29.62 
 
 
610 aa  96.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0834158 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29944  predicted protein  24.1 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1776  acyltransferase 3  29.58 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26322  predicted protein  21.3 
 
 
495 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1478  acyltransferase 3  30.77 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.120403  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0849  acyltransferase 3  21.83 
 
 
370 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0298936  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  25.07 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  31.43 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01396  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumF  27.54 
 
 
363 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0850077  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1534  GumF protein  30.2 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  26.6 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  25.34 
 
 
473 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2204  acyltransferase 3  28.57 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.517072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3631  acyltransferase 3  29.32 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.34905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  27.74 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  27.32 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  30.2 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  35.8 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  35.8 
 
 
435 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  35.8 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  35.8 
 
 
435 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  35.8 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  35.8 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1520  acyltransferase 3  26.95 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1544  acyltransferase 3  35.8 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  26.55 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  23.76 
 
 
352 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>