27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01396 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01396  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumF  100 
 
 
363 aa  713    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0850077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1478  acyltransferase 3  44.97 
 
 
363 aa  285  7e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.120403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1534  GumF protein  46.76 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  44.1 
 
 
371 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0199  acyltransferase  25.4 
 
 
365 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00737007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0199  acyltransferase family protein  26.38 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000876664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3394  Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferase-like protein  26.27 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2366  acyltransferase 3  28.92 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0328287  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0287  acyltransferase 3  27.13 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3505  acyltransferase 3  29.63 
 
 
373 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  27.27 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  27.27 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2204  acyltransferase 3  22.57 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.517072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5352  acyltransferase 3  26.84 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  0.0147975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0727  acyltransferase 3  33.05 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0834158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0634  hypothetical protein  31.73 
 
 
335 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0434683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4097  acyltransferase 3  27.21 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1544  acyltransferase 3  24.7 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2348  acyltransferase 3  33.67 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3266  acyltransferase 3  31.84 
 
 
349 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1362  Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferase-like protein  28.28 
 
 
675 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17520  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  34.04 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0364  hypothetical protein  35.14 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.018012  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3644  acyltransferase 3  23.92 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000222847  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0070  hypothetical protein  22.49 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2419  acyltransferase 3  25.66 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.897127  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1776  acyltransferase 3  30.77 
 
 
318 aa  43.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>