30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1534 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1478  acyltransferase 3  97.25 
 
 
363 aa  696    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.120403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1534  GumF protein  100 
 
 
363 aa  716    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01396  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumF  46.76 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0850077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  41.26 
 
 
371 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2419  acyltransferase 3  26.62 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.897127  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3394  Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferase-like protein  27.36 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2366  acyltransferase 3  27.05 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0328287  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  31.56 
 
 
473 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1544  acyltransferase 3  26.21 
 
 
387 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  39.09 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  39.09 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  42.53 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  42.53 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  42.53 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  42.53 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0287  acyltransferase 3  33.33 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0634  hypothetical protein  34.65 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0434683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2370  acyltransferase 3  27.55 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2204  acyltransferase 3  29.93 
 
 
352 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.517072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  34.78 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3505  acyltransferase 3  26.16 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  32.12 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  32.12 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1520  acyltransferase 3  40.22 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1458  hypothetical protein  24.39 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00543246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4097  acyltransferase 3  39.77 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0199  acyltransferase family protein  28.3 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000876664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3644  acyltransferase 3  25.37 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000222847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0364  hypothetical protein  41.18 
 
 
348 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.018012  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3799  hypothetical protein  28.33 
 
 
383 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.937718  normal  0.0900877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>