36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0287 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0287  acyltransferase 3  100 
 
 
391 aa  776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3505  acyltransferase 3  58.74 
 
 
373 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4097  acyltransferase 3  41.9 
 
 
376 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1362  Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferase-like protein  39.16 
 
 
675 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0364  hypothetical protein  41.06 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.018012  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0727  acyltransferase 3  38.55 
 
 
610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0834158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5352  acyltransferase 3  36.41 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  0.0147975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4837  acyltransferase 3  37.28 
 
 
382 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1850  acyltransferase 3  34.71 
 
 
371 aa  166  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.889698  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17520  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  39.21 
 
 
351 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1428  acyltransferase 3  35.34 
 
 
387 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0465028  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  30.22 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  30.22 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1338  acyltransferase 3  28.15 
 
 
332 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.179099  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2348  acyltransferase 3  31.4 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1350  acyltransferase 3  27.94 
 
 
369 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0722258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1110  acyltransferase family protein  25.95 
 
 
347 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000203806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16030  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  29.86 
 
 
340 aa  96.3  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109512  hitchhiker  0.000000313895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1936  acyltransferase 3  30.32 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0634  hypothetical protein  28.71 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0434683  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26322  predicted protein  28.21 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0849  acyltransferase 3  28.92 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0298936  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29944  predicted protein  26.88 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  34.39 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1776  acyltransferase 3  34.48 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2438  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01396  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumF  28.88 
 
 
363 aa  53.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0850077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1478  acyltransferase 3  27.75 
 
 
363 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.120403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1534  GumF protein  34.38 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2883  acyltransferase 3  26.74 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3631  acyltransferase 3  30.41 
 
 
350 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.34905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2975  acyltransferase 3  27.86 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  29.93 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  25.96 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  31.88 
 
 
473 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2204  acyltransferase 3  37.66 
 
 
352 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.517072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>