37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1197 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  100 
 
 
383 aa  735    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  90.33 
 
 
387 aa  596  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  90.18 
 
 
387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  68.56 
 
 
363 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  62.6 
 
 
356 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  67.41 
 
 
357 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  62.43 
 
 
372 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  49.16 
 
 
350 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  48.2 
 
 
352 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  48.9 
 
 
350 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  48.73 
 
 
370 aa  269  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  47.19 
 
 
348 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  47.53 
 
 
351 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  49.86 
 
 
351 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  44.41 
 
 
371 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  36.96 
 
 
351 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  37.02 
 
 
350 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  31.05 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  26.58 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  26.58 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  27.19 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  34.32 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  25.72 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  25.72 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  25.2 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  25.46 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  25.46 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  30.39 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  25.46 
 
 
357 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  30.69 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  28.73 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  25.07 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  26.74 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  24.07 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  25.17 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  32.26 
 
 
352 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  28.66 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>