44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1240 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  100 
 
 
347 aa  693    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  29.79 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  29.56 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  30.25 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  29.39 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  32.54 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  35.37 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  33.96 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  25.24 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  32.14 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  26.94 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  24.82 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  35.04 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  28.44 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  32.26 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  24.75 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  24.75 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  30.91 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  24.75 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  24.75 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  25.9 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  24.07 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  23.29 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  24.41 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  28.76 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  22.79 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  28.76 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  28.76 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  25.62 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  23.47 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  23.47 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  26.16 
 
 
431 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  23.77 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  28.42 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16030  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  28.31 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109512  hitchhiker  0.000000313895 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  25.93 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  25.75 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  25.75 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  26.17 
 
 
435 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  25 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  26.17 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05570  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  26.95 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  25.51 
 
 
331 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3644  acyltransferase 3  29.25 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000222847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>