42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4157 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  95.45 
 
 		 330 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  100 
 
 		 330 aa  663    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  66.16 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  66.16 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  66.16 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  63.25 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  58.61 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  58.61 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  58.61 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  58.91 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  58.61 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  58.61 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  57.96 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  56.5 
 
 		 331 aa  364  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  56.5 
 
 		 331 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  56.5 
 
 		 331 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  56.5 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  56.5 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  56.19 
 
 		 331 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  56.8 
 
 		 331 aa  362  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  28.77 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  28.77 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  28.77 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  28.77 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  28.77 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  26.36 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  26.88 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  27.22 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  27.85 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  24.03 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  23.31 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  24.41 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  23.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  45.16 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1180  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0744588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  23.12 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  30.56 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  29.66 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  23.01 
 
 		 362 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>