53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1382 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  739    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  34.66 
 
 
336 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  31.27 
 
 
334 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  32.43 
 
 
357 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  24.73 
 
 
343 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  27.53 
 
 
337 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  30.19 
 
 
352 aa  93.2  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  26.42 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  24.57 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  23.87 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  22.74 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  24.13 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  32.61 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  32.61 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  32.61 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  29.85 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  25.56 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  24.72 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  24.14 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  24.04 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2474  hypothetical protein  27.59 
 
 
315 aa  67  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  25.64 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  26.11 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  26.43 
 
 
331 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  26.43 
 
 
331 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  26.43 
 
 
331 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  26.18 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  26.9 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  26.11 
 
 
331 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  24.73 
 
 
384 aa  62.8  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  23.99 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06310  hypothetical protein  28 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  34.53 
 
 
331 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  23.7 
 
 
331 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  24.91 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  33.09 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  33.81 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  23.41 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  26.57 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1450  acyltransferase 3  30.61 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012691  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1141  hypothetical protein  20.11 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  hitchhiker  0.0000472475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  23.74 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1444  acyltransferase 3  24.69 
 
 
460 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  29.11 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2246  hypothetical protein  27.27 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal  0.322709 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  27.5 
 
 
379 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1364  acyltransferase  24.54 
 
 
386 aa  46.6  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.510476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1010  acyltransferase 3  26.25 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.114811  hitchhiker  0.00000776761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1039  acyltransferase 3  27.85 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0220437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>