34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1141 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1141  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  667    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  hitchhiker  0.0000472475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  21.56 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3034  hypothetical protein  24.42 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2961  hypothetical protein  24.42 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1862  hypothetical protein  24.42 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.378976  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  29.25 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  22.66 
 
 
336 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  21.43 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  24.27 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  24.43 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  23.66 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  23.66 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  23.36 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  23.66 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  23.51 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  24.03 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  24.03 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  24.03 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  23.34 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  25.56 
 
 
330 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  23.47 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  25.08 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  25.56 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  25.56 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  23.72 
 
 
331 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  23.72 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  24.6 
 
 
331 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  25.79 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  25.93 
 
 
362 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  25.5 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  25.5 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  23.15 
 
 
331 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  23.81 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  25.5 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>